El Consejo Superior Universitario es el máximo órgano de dirección y gobierno de la Universidad de Cundinamarca y está integrado por:

• El Gobernador del Departamento de Cundinamarca, quien lo preside.

• Un miembro designado por el Presidente de la República que tenga vínculos con el sector universitario.

• Un delegado del Ministro de Educación

• Un representante de las Directivas Académicas designado por éstas. Para éste efecto se entiende por directivas académicas el Consejo Académico, el Vicerrector Académico, los Decanos, los Directores de Institutos

• Un representante de los Docentes elegido por estos

• Un representante de los Egresados elegido por estos

• Un representante de los Estudiantes elegido por estos

• Un representante del Sector Productivo

• Un ex rector universitario

• El Rector de la Universidad de Cundinamarca con voz y sin voto.